Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACBD4Q8NC06 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACBD4Q8NC06 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACBD4Q8NC06 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms