Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUMF1Q8NBK3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUMF1Q8NBK3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUMF1Q8NBK3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms