Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC63Q8NA47 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC63Q8NA47 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC63Q8NA47 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms