Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN19Q8N6F1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN19Q8N6F1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN19Q8N6F1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN19Q8N6F1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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