Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms