Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV50

LYSMD2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD2Q8IV50 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD2Q8IV50 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD2Q8IV50 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYSMD2Q8IV50 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD2Q8IV50 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms