Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLD3Q8IV08 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLD3Q8IV08 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms