Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX29P2Q8IUI4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms