Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM17Q86X19 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM17Q86X19 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM17Q86X19 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms