Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APTXQ7Z2E3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APTXQ7Z2E3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APTXQ7Z2E3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APTXQ7Z2E3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APTXQ7Z2E3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APTXQ7Z2E3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
APTXQ7Z2E3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
APTXQ7Z2E3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APTXQ7Z2E3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms