Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHST9Q7L1S5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHST9Q7L1S5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST9Q7L1S5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHST9Q7L1S5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHST9Q7L1S5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHST9Q7L1S5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHST9Q7L1S5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHST9Q7L1S5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHST9Q7L1S5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHST9Q7L1S5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHST9Q7L1S5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST9Q7L1S5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST9Q7L1S5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST9Q7L1S5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms