Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KNDC1Q76NI1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
KNDC1Q76NI1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KNDC1Q76NI1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KNDC1Q76NI1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KNDC1Q76NI1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
KNDC1Q76NI1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KNDC1Q76NI1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KNDC1Q76NI1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KNDC1Q76NI1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KNDC1Q76NI1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KNDC1Q76NI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KNDC1Q76NI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KNDC1Q76NI1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
KNDC1Q76NI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
KNDC1Q76NI1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
KNDC1Q76NI1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
KNDC1Q76NI1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KNDC1Q76NI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KNDC1Q76NI1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KNDC1Q76NI1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KNDC1Q76NI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KNDC1Q76NI1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KNDC1Q76NI1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms