Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYS1Q717R9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYS1Q717R9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYS1Q717R9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms