Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE1Q6ZW31 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYDE1Q6ZW31 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms