Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HRCT1Q6UXD1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms