Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD1Q6UWL2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD1Q6UWL2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD1Q6UWL2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms