Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC137Q6PK04 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC137Q6PK04 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms