Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCE2Q6PIF2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE2Q6PIF2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCE2Q6PIF2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCE2Q6PIF2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms