Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM88Q6PEY1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM88Q6PEY1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms