Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFXN4Q6P4A7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN4Q6P4A7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFXN4Q6P4A7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms