Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAVIN1Q6NZI2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN1Q6NZI2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CAVIN1Q6NZI2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN1Q6NZI2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms