Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMBOX1Q6NT76 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMBOX1Q6NT76 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMBOX1Q6NT76 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms