Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB12Q6IQ22 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB12Q6IQ22 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms