Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGNBP1Q5YKI7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GGNBP1Q5YKI7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GGNBP1Q5YKI7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms