Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHEQ5VZ18 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHEQ5VZ18 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms