Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
OBSCNQ5VST9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms