Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LDLRAD1Q5T700 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LDLRAD1Q5T700 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LDLRAD1Q5T700 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LDLRAD1Q5T700 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LDLRAD1Q5T700 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LDLRAD1Q5T700 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms