Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NHSL1Q5SYE7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NHSL1Q5SYE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NHSL1Q5SYE7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NHSL1Q5SYE7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NHSL1Q5SYE7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NHSL1Q5SYE7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NHSL1Q5SYE7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NHSL1Q5SYE7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NHSL1Q5SYE7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
NHSL1Q5SYE7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NHSL1Q5SYE7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NHSL1Q5SYE7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NHSL1Q5SYE7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NHSL1Q5SYE7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
NHSL1Q5SYE7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NHSL1Q5SYE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms