Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM240Q5SV17 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM240Q5SV17 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM240Q5SV17 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM240Q5SV17 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms