Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK2Q58EX2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDK2Q58EX2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDK2Q58EX2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms