Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A9Q2M3M2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC5A9Q2M3M2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC5A9Q2M3M2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC5A9Q2M3M2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms