Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A12Q1EHB4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A12Q1EHB4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A12Q1EHB4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms