Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms