Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRR4Q16378 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRR4Q16378 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRR4Q16378 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRR4Q16378 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRR4Q16378 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRR4Q16378 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRR4Q16378 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRR4Q16378 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRR4Q16378 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRR4Q16378 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRR4Q16378 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRR4Q16378 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRR4Q16378 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRR4Q16378 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRR4Q16378 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRR4Q16378 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRR4Q16378 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRR4Q16378 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRR4Q16378 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRR4Q16378 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRR4Q16378 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms