Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NTRK3Q16288 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NTRK3Q16288 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NTRK3Q16288 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NTRK3Q16288 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
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