Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6AP1Q15904 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1Q15904 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
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