Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAMP3Q15836 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP3Q15836 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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