Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRK1Q15835 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRK1Q15835 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRK1Q15835 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms