Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDSNQ15517 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDSNQ15517 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDSNQ15517 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms