Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
UBE3CQ15386 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBE3CQ15386 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBE3CQ15386 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBE3CQ15386 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
UBE3CQ15386 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
UBE3CQ15386 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
UBE3CQ15386 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE3CQ15386 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE3CQ15386 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE3CQ15386 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBE3CQ15386 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
UBE3CQ15386 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBE3CQ15386 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms