Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHD4Q14839 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CHD4Q14839 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHD4Q14839 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CHD4Q14839 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
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