Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA9Q13797 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA9Q13797 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA9Q13797 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA9Q13797 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
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