Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
SHROOM2Q13796 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
SHROOM2Q13796 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SHROOM2Q13796 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
SHROOM2Q13796 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SHROOM2Q13796 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
SHROOM2Q13796 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
SHROOM2Q13796 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SHROOM2Q13796 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SHROOM2Q13796 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SHROOM2Q13796 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SHROOM2Q13796 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SHROOM2Q13796 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SHROOM2Q13796 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SHROOM2Q13796 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SHROOM2Q13796 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SHROOM2Q13796 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
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