Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
CACNA1SQ13698 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CACNA1SQ13698 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CACNA1SQ13698 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CACNA1SQ13698 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CACNA1SQ13698 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
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