Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTCH1Q13635 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTCH1Q13635 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTCH1Q13635 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PTCH1Q13635 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTCH1Q13635 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTCH1Q13635 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTCH1Q13635 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTCH1Q13635 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTCH1Q13635 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTCH1Q13635 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTCH1Q13635 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
PTCH1Q13635 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTCH1Q13635 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTCH1Q13635 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTCH1Q13635 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTCH1Q13635 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTCH1Q13635 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTCH1Q13635 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTCH1Q13635 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTCH1Q13635 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTCH1Q13635 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTCH1Q13635 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTCH1Q13635 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
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