Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXE3Q13461 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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FOXE3Q13461 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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