Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLN3Q13286 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLN3Q13286 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLN3Q13286 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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