Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MKRN3Q13064 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MKRN3Q13064 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MKRN3Q13064 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MKRN3Q13064 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MKRN3Q13064 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MKRN3Q13064 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MKRN3Q13064 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
MKRN3Q13064 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MKRN3Q13064 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MKRN3Q13064 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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