Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 NDE2YDL085W 1638 nt7.81□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 ALG7YBR243C 1347 nt7.81□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 GTB1YDR221W 2109 nt7.81□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 LEA1YPL213W 717 nt7.81□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 SNP1YIL061C 903 nt7.8□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 HBS1YKR084C 1836 nt7.8□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 DTR1YBR180W 1719 nt7.79□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 WSC3YOL105C 1671 nt7.79□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 YML079WYML079W 606 nt7.78□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 MRP7YNL005C 1116 nt7.78□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 MNN9YPL050C 1188 nt7.78□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 DUR3YHL016C 2208 nt7.77□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 MRN1YPL184C 1839 nt7.77□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 ILV2YMR108W 2064 nt7.76□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 DST1YGL043W 930 nt7.76□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 YGR137WYGR137W 375 nt7.76□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 TDA4YJR116W 840 nt7.76□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 RPR1RPR1 369 nt7.76□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 WSC4YHL028W 1818 nt7.75□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 TGL5YOR081C 2250 nt7.75□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.75□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 MTC6YHR151C 1581 nt7.75□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 HEM14YER014W 1620 nt7.74□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 FTH1YBR207W 1398 nt7.74□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 GLY1YEL046C 1164 nt7.74□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 RSC4YKR008W 1878 nt7.74□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 FIT1YDR534C 1587 nt7.73□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 UFD1YGR048W 1086 nt7.72□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 DUS3YLR401C 2007 nt7.72□□□□□ -1.17
LCB4Q12246 DOC1YGL240W 753 nt7.71□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 INM1YHR046C 888 nt7.71□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 ELP6YMR312W 822 nt7.71□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 YNL140CYNL140C 570 nt7.71□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 ERV2YPR037C 591 nt7.71□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 MAS1YLR163C 1389 nt7.71□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 STE3YKL178C 1413 nt7.7□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 CRN1YLR429W 1956 nt7.7□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 PUP2YGR253C 783 nt7.7□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 COS10YNR075W 1125 nt7.7□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 YNL295WYNL295W 1575 nt7.69□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 YJR142WYJR142W 1029 nt7.69□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 TIF3YPR163C 1311 nt7.69□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 RRP43YCR035C 1185 nt7.68□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 PSA1YDL055C 1086 nt7.67□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 NMA2YGR010W 1188 nt7.67□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 CPR2YHR057C 618 nt7.67□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 TES1YJR019C 1050 nt7.67□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 HAM1YJR069C 594 nt7.67□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 UME1YPL139C 1383 nt7.67□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 GAL2YLR081W 1725 nt7.66□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 PIH1YHR034C 1035 nt7.66□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 CYS3YAL012W 1185 nt7.66□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 ATP23YNR020C 813 nt7.66□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 ORT1YOR130C 879 nt7.66□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 AOS1YPR180W 1044 nt7.66□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 SPS1YDR523C 1473 nt7.65□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 STS1YIR011C 960 nt7.65□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.65□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 snR4snR4 186 nt7.65□□□□□ -1.18
LCB4Q12246 INP54YOL065C 1155 nt7.64□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 OSM1YJR051W 1506 nt7.63□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 ADH6YMR318C 1083 nt7.63□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 KTR4YBR199W 1395 nt7.62□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 SLM3YDL033C 1254 nt7.62□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 YGL081WYGL081W 963 nt7.61□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 LPD1YFL018C 1500 nt7.61□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 CDC3YLR314C 1563 nt7.6□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 ERV25YML012W 636 nt7.6□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 YBL111CYBL111C 2004 nt7.6□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 CKI1YLR133W 1749 nt7.6□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 MSI1YBR195C 1269 nt7.59□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 MAS2YHR024C 1449 nt7.59□□□□□ -1.19
LCB4Q12246 TPO1YLL028W 1761 nt7.59□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 PPZ2YDR436W 2133 nt7.58□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 YPC1YBR183W 951 nt7.58□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 MCM5YLR274W 2328 nt7.58□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 HRB1YNL004W 1365 nt7.58□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 CDA1YLR307W 906 nt7.57□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 SKP1YDR328C 585 nt7.56□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 YPQ1YOL092W 927 nt7.56□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 MBF1YOR298C-A 456 nt7.56□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 ADE16YLR028C 1776 nt7.56□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 LAT1YNL071W 1449 nt7.55□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 YOX1YML027W 1158 nt7.55□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 YPT10YBR264C 600 nt7.55□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 YHR033WYHR033W 1272 nt7.54□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 TRR2YHR106W 1029 nt7.54□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 URA1YKL216W 945 nt7.54□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 PRY2YKR013W 990 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 DAL80YKR034W 810 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 YPL067CYPL067C 597 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB4Q12246 RFC1YOR217W 2586 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 GET2YER083C 858 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 PTH2YBL057C 627 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 DSC3YOR223W 879 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 AVL9YLR114C 2295 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 YDR306CYDR306C 1437 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 PFS2YNL317W 1398 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 AIM46YHR199C 933 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 VPS65YLR322W 315 nt7.5□□□□□ -1.21
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