Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YGR210CYGR210C 1236 nt8.95□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 MAL31YBR298C 1845 nt8.94□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 YOR041CYOR041C 432 nt8.93□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 PRE10YOR362C 867 nt8.93□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 YBL113CYBL113C 2379 nt8.93□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.92□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.92□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.92□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 GNA1YFL017C 480 nt8.92□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 SER2YGR208W 930 nt8.92□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 FCY1YPR062W 477 nt8.92□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 YBR232CYBR232C 360 nt8.92□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 DCR2YLR361C 1737 nt8.91□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 SAM50YNL026W 1455 nt8.9□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 YER137CYER137C 447 nt8.9□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 VPS65YLR322W 315 nt8.9□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 POB3YML069W 1659 nt8.9□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 RRT14YIL127C 621 nt8.89□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 ERV25YML012W 636 nt8.89□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 GCD11YER025W 1584 nt8.89□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 TIM50YPL063W 1431 nt8.88□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 ARG7YMR062C 1326 nt8.88□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 GGC1YDL198C 903 nt8.88□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 JHD1YER051W 1479 nt8.88□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 YKR018CYKR018C 2178 nt8.88□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.87□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 YPL108WYPL108W 507 nt8.87□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 HTS1YPR033C 1641 nt8.87□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 AQR1YNL065W 1761 nt8.86□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 RMD8YFR048W 1989 nt8.84□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 RPL12BYDR418W 498 nt8.84□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 YHR033WYHR033W 1272 nt8.84□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 PET10YKR046C 852 nt8.84□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 NAP1YKR048C 1254 nt8.84□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 BXI1YNL305C 894 nt8.84□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 RPS6AYPL090C 711 nt8.84□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 RPS6BYBR181C 711 nt8.84□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 HNM1YGL077C 1692 nt8.84□□□□□ -0.99
LSP1Q12230 PRB1YEL060C 1908 nt8.82□□□□□ -1
LSP1Q12230 TPI1YDR050C 747 nt8.82□□□□□ -1
LSP1Q12230 YMR206WYMR206W 942 nt8.82□□□□□ -1
LSP1Q12230 YPC1YBR183W 951 nt8.82□□□□□ -1
LSP1Q12230 CDC23YHR166C 1881 nt8.81□□□□□ -1
LSP1Q12230 YJL043WYJL043W 774 nt8.81□□□□□ -1
LSP1Q12230 BNA3YJL060W 1335 nt8.8□□□□□ -1
LSP1Q12230 PET18YCR020C 648 nt8.8□□□□□ -1
LSP1Q12230 GTS1YGL181W 1191 nt8.8□□□□□ -1
LSP1Q12230 FRT1YOR324C 1809 nt8.8□□□□□ -1
LSP1Q12230 ECM10YEL030W 1935 nt8.79□□□□□ -1
LSP1Q12230 CAR2YLR438W 1275 nt8.77□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 YML034C-AYML034C-A 399 nt8.77□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 CTF3YLR381W 2202 nt8.77□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 YPR084WYPR084W 1371 nt8.76□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 PMU1YKL128C 888 nt8.76□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 PRY2YKR013W 990 nt8.76□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 ATO2YNR002C 849 nt8.76□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 TOD6YBL054W 1578 nt8.76□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 RTC2YBR147W 891 nt8.75□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 TCB1YOR086C 3561 nt8.75□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 SEC24YIL109C 2781 nt8.75□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 CAN1YEL063C 1773 nt8.74□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 SNF7YLR025W 723 nt8.74□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 YDR215CYDR215C 414 nt8.73□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 YJL064WYJL064W 396 nt8.73□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 ADE2YOR128C 1716 nt8.73□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 MSS51YLR203C 1311 nt8.73□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 DAL80YKR034W 810 nt8.72□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 YAH1YPL252C 519 nt8.72□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 CKI1YLR133W 1749 nt8.71□□□□□ -1.01
LSP1Q12230 CPR2YHR057C 618 nt8.71□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.71□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 HRA1HRA1 564 nt8.7□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 SEN2YLR105C 1134 nt8.7□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt8.7□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 FLC2YAL053W 2352 nt8.7□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 YDR327WYDR327W 327 nt8.69□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 YIL168WYIL168W 384 nt8.68□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 APT1YML022W 564 nt8.68□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 RFS1YBR052C 633 nt8.68□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 PMA2YPL036W 2844 nt8.68□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 MAM3YOL060C 2121 nt8.68□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 YJL160CYJL160C 864 nt8.67□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 SNU66YOR308C 1764 nt8.67□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 MAS2YHR024C 1449 nt8.66□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 STE3YKL178C 1413 nt8.66□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 YER156CYER156C 1017 nt8.66□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 ATP2YJR121W 1536 nt8.65□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 LIP5YOR196C 1245 nt8.65□□□□□ -1.02
LSP1Q12230 YNL295WYNL295W 1575 nt8.65□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 UTR5YEL035C 501 nt8.64□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 PAU19YMR325W 375 nt8.64□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 MCM5YLR274W 2328 nt8.64□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 NDE1YMR145C 1683 nt8.63□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 SNF4YGL115W 969 nt8.63□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 FCY2YER056C 1602 nt8.62□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 ENB1YOL158C 1821 nt8.62□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 INP54YOL065C 1155 nt8.62□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 YGL260WYGL260W 231 nt8.61□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt8.61□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 YKL147CYKL147C 618 nt8.61□□□□□ -1.03
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